成都肛肠专科医院源于著名痔瘘泰斗黄济川先生于1884年在四川泸州开办的痔瘘诊所，1904年迁移至成都少城，称黄济川痔瘘医院。1956年改制后正式成为全国第一家公立肛肠专科医院，称成都痔瘘专科医院。1998年由成都市卫生局更名为成都肛肠专科医院，2012年成为国家二级甲等专科医院，同年顺利通过了国家三级乙等专科医院评审。
　　20世纪50年代，黄老用其高超独到的祖传秘方为一些重要领导诊治后，其医术享誉九州，受到周总理亲切接见与鼓励。新中国中医外科四大名医黄济川、石筱山、杜自明、赵炳南，于1956年7月跻身于中华医学会外科学会常务委员。其中黄济川与“中国外科之父”裘法祖等一起任学会四位副主任委员之一，获得了中医外科在我国医学史上最高的学术地位。同时黄济川也是四川省最早的四大名中医之一（黄济川、张文修、李斯炽、卓雨农）。
三个世纪以来，医院大力弘扬祖国医学的优良传统，继承和发扬黄老先生丰富的肛肠医学遗产，运用现代医学创立了一整套独具中西医结合专科特色的治疗方法，医院坚持走“大专科，小综合”发展之路，至今已为国内外数百万计的肛肠病患者解除了病痛。
　　目前医院开放病床208张，下设8个临床科室，并设立了全国首个肛肠VIP病区及全国首个便秘病区。拥有大肠肛门病专业主任医师7人，副主任医师25人，麻醉师6人。在医教研各方面齐抓共管，目前拥有硕、博士研究生21人，承担部、省、市、区各级课题20余项。医院党政领导历年来高度重视教学，把教学工作作为关系医院发展的战略任务来抓，“科教兴医、科教兴院，以教学促医疗、促医院发展”已成为医院上下的共识，医院规模、科室设置、诊疗仪器设备、住宿条件、教学设施、声像、图书资料等教学条件能满足临床教学需要。医院拥有手术室9间，先进数字化动态平板摄影系统，丹麦造彩色多普勒超声诊断扫描仪，日本奥林巴斯电子肠镜，丹麦造胃肠动力学检查系统等价值1500余万大型专科设备。医院教学管理规范有序，管理机构完整，岗位职责明确，管理制度健全，师资队伍结构合理稳定，认真组织实施教学，各项教学任务得到落实。真正达到“以评促教、以评促改，教学相长，以教学促科研、以教学促医疗”的目的，促进医院可持续发展。
　　医院目前是国家中医药管理局重点学科单位，国家中医药管理局重点专科单位，四川省医学甲级重点专科——肛肠科，医院设有“全国中医肛肠学科名专家”工作室2个，“四川省名中医”工作室1个，“成都市名中医”工作室1个。拥有四川省中医药学会副秘书长1人；四川省中西医结合学会副会长1人；成都市中医药学会副理事长1人；中国PPH技术（规范）资格认证专家委员会主任委员、秘书长各1人；中国便秘联谊会主席2人、会长1人、秘书长1人、副会长1人、常务副秘书长1人、副秘书长1人、常务理事10人；中医药高等教育学会肛肠分会顾问会长1人、秘书长1人、副会长2人、副秘书长1人、常务理事7人；中华中医药学会肛肠分会副会长1人、副秘书长1人、常务理事7人；世界中医药学会联合会肛肠专业委员会副会长1人、副秘书长1人、常务理事1人；中国中西医结合学会大肠肛门病专业委员会常务理事1人；四川省中医药学会肛肠专业委员会正副主任委员各1人；成都市中医药学会肛肠专业委员会正副主任委员各1人；中国肛肠病学研究生联合会正副会长、秘书长各1人。