中国医科大学附属第二医院二部座落在全国最大的居民住宅区--沈阳市铁西区滑翔小区内。其前身是创建于1994年6月的中国医科大学附属第三医院，2002年10月由中国医科大学附属第二医院接管，易名为中国医科大学附属第二医院二部。二部现有床位208张，职工273人，其中硕士生导师10人，副高级职称以上20余人，同时本部专家每天轮流去二部出诊、查房、会诊及手术。二部设内科、神经内科、外科、神经外科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、放射线科、检验科、病理科、功能科、药局、麻醉科、手术室、透析室等二十个医疗和医技科室。拥有大型设备包括：全身CT、大型X光机、彩色多普勒、B超、血液透析机、全自动生化分析仪等。开展新技术新项目包括：心脏内科人工起搏器的安装置入、心脏射频消融术；外科经腹腔镜胆囊、阑尾切除术，包膜外剥除肝巨大海绵状血管瘤；妇产科应用腹腔镜开展了卵巢瘤核除术、子宫粘膜下肌瘤切除术、宫外孕输卵管切除术等；眼科利用超声乳化手术仪开展白内障人工晶体植入术；儿科应用雾化吸入疗法治疗儿童哮喘和毛细支气管炎；骨科开展了骨科领域相对复杂的手术，如颈椎病、脊柱侧弯矫形等。近年来，二部共承担国家、省、市科研课题7项，其中获省科技成果奖3项，市科技成果奖2项，市科技进步奖2项，发表国家级论文136篇。沈阳市儿童哮喘病治疗中心也设在此。二部还承担着中国医科大学日文医学班部分课间和临床实习任务。