盱眙县中医院是一所综合性二级甲等中医医院，是盱眙县惠民医院、盱眙县职工/城镇居民医疗保险和新型农村合作医疗保险定点医疗机构，是南方医科大学附属苏北医院、南京中医药大学翰林学院附属医院、安徽中医药大学教学医院、江苏省中医院协作医院、江苏省中医药学会高级专家科技服务站、江苏省骨质疏松防治体系盱眙协作组、河南省洛阳正骨医院合作医院、东南大学附属中大医院合作医院、南京都市圈中医发展联合体成员单位。医院现有职工788人，其中专业技术人员占77％，副主任医师以上职称的医疗专家41位，中级职称94人，特聘高级医疗专家12位、南京中医药大学兼职副教授2人（兼职讲师17人）、硕士研究生24名、博士2名。医院现有建筑面积五万余平方米，实际开放床位700张，拥有功能健全、设施一流的23层综合大楼及外科楼、急诊医技楼，设置装备先进的层流手术室，设立住院病区19个、专科专病门诊25个，其中，脑病科是江苏省中医重点专科建设单位，脑病科、骨伤科、肝病科、肛肠科、妇科是淮安市中医临床重点专科。医院现拥有美国瓦里安直线加速器、美国GE大平板数字化血管造影机、美国GE1.5T超导磁共振、飞利浦64排螺旋CT、飞利浦16排螺旋CT、西门子螺旋CT、岛津DR数字化拍片系统、岛津Flexavision数字化多功能透视/摄影系统、美国GE钼铑靶乳腺X光机等内外先进医疗设备一百余台套。