自1978年以来，共获科研成果奖400余项，其中**科技成果奖8项，部省级200余项，市厅级300余项。陈子兴教授等的单篇论文经SCI检索自1995年起连续三年国际引用次数名列全国**；2002年SCI排序名列全国医疗机构第30位，列江苏省首位；2004年由骨科唐天驷教授杨惠林教授等主持研究的科研成果“脊柱后路经椎弓根内固定的基础和临床研究”，荣获了国家科技进步二等奖；阮长耿院士所带博士生获得全国百名**博士论文奖，实现了苏州大学零的突破；血研所成功培育出世界罕有白血病细胞系株，为世界白血病研究做出重大贡献。
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