北京市复康眼科医院有角膜并白内障、青光眼、眼底外科等12个专科及OCT、荧光造影等24个辅助科室；眼科研究所有免疫、视觉生理、遗传分子生物学、病理等8个专业实验室，开设黄斑并葡萄膜炎病等临床专科。其中角膜移植、准分子激光角膜屈光矫正手术、白内障的手术治疗和葡萄膜视网膜炎发病机制系列研究居国内领先地位，达国际先进水平；青光眼和视网膜玻璃体疾病的诊治居国内先进行列。