护国寺中医院始建于1952年。是北京市成立最早的公立中医医疗机构之一。从六十年代起，就作为北京中医学院(现北京中医药大学)的教学，实习医院，1994年正式成为北京中医药大学附属医院。1995年被评为国家二级甲等中医医院，1996年被评为全国示范中医医院。1997年又被评为首都精神文明先进单位和西城区文明示范窗口单位。同时还作为中国中医研究院针灸研究所外国留学生的临床实习医院，每天接待大虽国内外学习、参观、就诊人员。
护国寺中医院以中医中药为主体，是全面承担着医疗、教学、科研、预防、社区保健和康复任务的综合性中医医院，在国内、外享有较商声誉。现有职工500多人，其中高级职称专业技术人员50余人，技术力量雄厚。医院开设有内、外、针、骨科病床300张。门诊设中医内、外，针、骨、妇、儿，皮、眼、五官、口腔、急诊、肠道及放射、检验、心电、超声、心脑功能检查、胃镜、理疗、手术室、中西药房、中西药制剂等科室30余个。有普通门诊、专家门诊、外宾门诊为患者提供优质服务。每日门诊量近千人次，全年无休日开诊。